如何安装conda包

[!NOTE]

conda安装好后默认激活base环境，不建议在base下安装太多包！！！

1.在conda环境中安装指定的conda包

登录服务器终端执行以下命令

# 安装numpy，版本号为1.26.3
conda install numpy==1.26.3 -c conda-forge

# 使用数信云自建conda镜像来安装软件：
# conda-forge替换为http://sxygptcloud.com:6002/conda/conda-forge
# bioconda替换为http://sxygptcloud.com:6002/conda/bioconda

示例：

创建一个名为bwa_env的conda环境，并安装最新版的bwa软件

# 创建一个名为bwa_env的conda环境
conda create -n bwa_env

# 激活bwa_env环境
conda activate bwa_env

# 安装bwa，默认最新版
conda install bwa -c conda-forge -c bioconda

# 使用数信云自建conda镜像来安装软件：
# conda-forge替换为http://sxygptcloud.com:6002/conda/conda-forge
# bioconda替换为http://sxygptcloud.com:6002/conda/bioconda

2.在conda环境中使用pip安装包

登录服务器终端执行以下命令

# 创建一个名为bwa_env的conda环境
conda create -n bwa_env

# 激活bwa_env环境
conda activate bwa_env

# 安装pandas，默认最新版
pip install pandas

温馨提示：conda安装和pip安装不建议混用，容易造成依赖冲突

比如对于pandas这个包，先通过conda来安装，又通过pip来安装，这是不对的！