Jupyter高频错误

Jupyter高频错误#

1.运行程序的过程中Jupyter突然崩溃:

image-20250827145439391

这个bug在Jupyterhub的github官网下也有许多人报告:

image-20250827145621510

我们根据服务器用户的使用情况,总结出了以下的解决方案,大家可以对号入座:

a.运行scanpy的sc.pp.neighbors()

解决方案:

# 在程序开始前强制限制线程数,必须把代码放在脚本的第一行!
import os
os.environ["PYTHONTHREADPOOL"] = 4
os.environ["MKL_NUM_THREADS"] = 4
os.environ["OMP_NUM_THREADS"] = 4
os.environ["OPENBLAS_NUM_THREADS"] = 4

然后就可以防止内核崩溃了~

2.突然无法打开ipynb文件:

image-20250827154641402

解决方案:

清空一下浏览器缓存,然后重新登录Jupyter