Jupyter使用指定的conda环境

Jupyter使用指定的conda环境#

[!NOTE]

当你在jupyterhub里创建了一个新的ipynb脚本时，如何使用指定的conda环境？

我们以conda环境sxy_celltypist为例

1.在指定的conda环境里安装依赖

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在终端执行以下命令，替换为你想要使用的conda环境

# 激活对应环境
conda activate 环境名
# 安装ipykernel包
pip install ipykernel

2.将conda环境连接入Jupyter

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在终端执行以下命令，替换为你想要使用的conda环境

python -m ipykernel install --user --name=环境名

3.回到Jupyter创建指定conda环境的ipynb文件

按照红色箭头的指引，首先点击1.(ipykernel)，然后选择2.(sxy_celltypist)，那么就成功开始使用sxy_celltypist作为ipynb的环境了！

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